외계로부터 생명공학을 연구하던 외계인박사 한명이 지구로 피신을 하여 오게된다. 평화스럽던 지구에 괴사내들이 나타나 박사를 찾기위해 오계인 특유의 초전파를 쫓아다니던중 초전자파를 파생하는 지구인을 무차별 공격 많은 어린이들이 희생하게 된다.한편 악당 죠안나일당은 미라의 몸에서 파생되는 초전파를 느끼고 미라를 납치하려다 미라가 식물인간이 된다.훈과 혁은 그런미라를 도울방법을 생각하다 미라를 몰래 병원에서 빼어내서 동굴로 찾아간다. 외계박사는 세아이의 우정에 감복하여 세어린이에게 우주의 영웅적전사인 시그마의 초능력을 부여하게 된다.한편, 악당들은 박사를 잡으러 미라의 이모를 납치하여 박사를 유인한다. 처절히 당한 박사를 초능력 시그마로 합체한 삼총사 시그마의 위력으로 외계악당들을 물리치고 박사를 구하게 된다.