Disc 1
- 본편

* Disc 2 : 서플

- The Making of Superman II (1980 TV Special) (52:11)
- Superman 50h Anniversary (1988 TV Special) (48:06)
- First Flight: The Fleischer Superman Series (12:25)
- 8편의 애니메이션
① Japoteurs 9:05
② Showdown 8:20
③ Eleventh Hour 8:57
④ Destruction, Inc. 8:38
⑤ The Mummy Strikes 7:46
⑥ Jungle Drums 9:00
⑦ The Underground World 8:12
⑧ Secret Agent 7:38

* Disc 3

- The Donner Cut (142분, 리처드 도너의 “감독판”) :
수퍼맨 1 제작 당시, 감독인 리처드 도너는 <수퍼맨2>를 동시에 제작하여 거의 완성을 앞두고 있었으나, 제작자와의 갈등으로 인해 1편만을 완성하고 떠난다. 2편의 새로운 감독이 된 리처드 레스터는 컨셉만을 살린채 리처드 도너가 생각했던 비전에서 많이 벗어난 속편을 완성하여 세상에 내놓게 된다. 3번째 디스크에 담긴 Donner Cut은 수퍼맨2를 리처드 도너의 오리지날 비전에 따라 재구성한 작품으로, 리처드 도너가 직접 참여했으며 영화 역사상 처음으로 프로젝트를 떠난 감독이 다시 돌아와 영화를 완성시킨 케이스가 됐다. 극장 개봉판보다 15분이 늘어난 Donner Cut에는 전혀 새로운 영화 시작과 결말이 새로 추가됐으며, 헐리웃의 전설인 말론 브란도 (Marlon Brando)가 등장하는 씬도 추가됐다.

- Special features (30:06)
① Superman II: Restoring the Vision (20:00)
② Deleted Scenes (8:09)
③ Introduction by Richard Donner (1:57)

크립톤 행성의 지배자 조엘은 나라의 안정을 위협한 조드와 얼사, 논을 팬텀존이라는 유리감옥에 가둬 우주로 추방한다. 하지만 우주에서 일어난 폭발로 인해 유리감옥은 산산조각이 나고, 이들 세 악당은 감옥에서 벗어나 지구에 도달하게 된다.

한편 클락과 함께 나이아가라 폭포로 취재차 나와 있던 로이스는 결국 클락이 슈퍼맨임을 알아낸다. 이에 클락은 그녀와의 사랑을 택하기로 결심하고 고독의 요새에서 슈퍼맨의 힘을 포기한다. 하지만 메트로폴리스로 돌아온 이 새로운 커플을 기다리고 있는 건 벌써 백악관을 점령하고 절대 복종과 슈퍼맨의 항복을 요구하는 조드의 대국민 성명이었으니…