스페셜피쳐(자막: 스페인어, 포르투갈어)
* Extended Cut: <엑스 파일> 확장판
* Audio Commentary by Rob Bowman, Chris Carter, Frank Spotnitz and Daniel Sackheim (Theatrical & Extended Cut) : 롭 바우만, 크리스 카터, 프랭크 스포트니츠, 다니엘 색헤임의 음성 해설
* Original 1999 Commentary by Rob Bowman and Chris Carter (Extended Cut)
: 롭 바우만과 크리스 카터의 1999년 오리지널 음성 해설
* Alternate Bee Sting Scene : 멀더와 스컬리 키스 장면의 다른 버전
* Gag Reel: NG 장면
* Blackwood: The Making of The X-Files: Fight the Future (2008) : 2008년 새롭게 만들어진 <엑스 파일> 제작 과정
* Visual Effects: <엑스 파일>의 시각 효과
* Scoring: 작곡가 마크 스노우의 영화 음악 소개
* Making of The X-Files Movie (1998) : 1998년 만들어진 <엑스파일> 제작 과정
* The X-Files: I Want to Believe Trailer : <엑스 파일: 나는 믿고 싶다> 예고편
* Theatrical Trailers: <엑스 파일> 영화 예고편 3개
* Still Galleries: 스틸 갤러리
Concept Art - 컨셉트 아트 / Storyboards - 스토리보드 / Unit Photography - 촬영 현장 사진
Blu-ray EXCLUSIVE CONTENT * In-Movie-Features (For Extended Cut Only) : 본편 재생 중 리모콘의 4가지 색깔의 버튼을 눌러 관련 정보에 접근할 수 있는 기능
녹색-PIP 코멘터리 / 파란색-비하인드 카메라 / 노란색-스토리보드 & 컨셉트 아트 / 붉은색-다른 버튼의 현재 진행 사항을 텍스트로 표시
* Picture-In-Picture Commentary by Rob Bowman, Chris Carter, Frank Spotnitz and Daniel Sackheim (Extended Cut) : 롭 바우만, 크리스 카터, 프랭크 스포트니츠, 다니엘 색헤임의 PIP 코멘터리
* D-BOX Motion Code: D-BOX 모션 코드 삽입

댈러스의 한 빌딩에서 폭발사고가 있을 것이라는 정보를 입수한 FBI 특수요원 멀더(데이빗 듀코브니)와 스컬리(질리안 앤더슨)는 현장조사에 나섰다가 전혀 예상치 못했던 곳에서 폭발물을 찾아낸다. 그러나 이미 폭발장치를 정지시키기에는 시간이 너무 촉박한 상황. 사람들을 최대한 건물 밖으로 대피시키고 인명피해를 최소화 하지만 멀더의 상사는 그곳에서 최후를 맞는다. 사고를 조사 중이던 멀더는 아버지의 옛 동료로부터 이 사건이 정부가 은폐하려는 외계인의 실체와 관계되어 있다는 충격적인 사실을 듣게 되는데...