1573년 텐쇼 시대 여름, 천하 제패에 혈안이 된 오다 노부나가는 아사쿠라 요시카게와 아사이 나가마사의 닌자 연합을 공격한다. 이에 따라 몇 년 전 히에이 산에 불을 지르고 승려 1,600여 명을 죽이는 등 이미 닌자 최대의 적이 된 노부나가를 처치하기 위해 모모치 주둔지와 후지바야시 주둔지의 닌자들이 각자 모여 방법을 의논한다. 그 중 모모치 주둔지의 고에몬은 스승인 산다유의 신임을 얻으며 최고 고문에 등극하고 언젠가 스승을 능가하는 닌자가 되겠다고 다짐한다. 그러던 어느 날, 고에몬 앞에 스승님의 아내인 이노네가 나타나고 둘은 사랑을 느낀다. 하지만 산다유는 곧 그들의 관계를 알아채고 고에몬에게 도둑이 되어 노부나가를 처치하기 위한 전쟁 비용을 댈 것을 명하는데……. 잡히면 진실을 감추기 위해 그 어떤 고문도 참아내야 하고 정체를 밝히는 대신 죽음을 택해야 하는 닌자의 슬픈 운명이 생생한 역사를 통해 우리 앞에 펼쳐진다.