하나뿐인 소중한 아들을 지키려는 아빠의 사랑

아름다운 크라운피쉬 부부 코랄과 말린은 행복하게 지내던 어느 날 상어의 습격을 받는다. 상어의 습격으로 수많은 알들과 아내를 잃은 말린은 하나 남은 알을 아내가 원하는 대로 ‘니모’라고 이름 지어 정성스레 키운다. 니모가 학교 갈 나이가 되자 말린은 불안해하며 니모를 학교로 데리고 간다. 체험학습을 나간 어느 날 니모가 잠수부에게 잡혀가는 사건이 발생한다. 잠수부가 흘린 수경의 주소를 따라 시드니로 가면서 니모 아빠인 말린의 모험이 시작된다. 시드니로 아들 니모를 찾아가면서 상어의 공격도 받고 해파리도 만나고 건망증이 심하지만 소중한 친구 도리도 만나게 된다.