• 오디오: 영어 5.1 DTS-HD MASTER AUDIO, 체코어 5.1, 힌디어 5.1, 헝가리어 5.1,일본어 5.1, 러시아어 5.1, 텔루구어 5.1, 태국어 5.1
• 본편 자막: 한국어, 영어, 영어 SDH, 아랍어, 불가리아어, 중국어, 크로아티아어, 체코어, 그리스어, 히브리어, 힌디어, 헝가리어, 아이슬란드어, 일본어, 폴란드어, 포르투갈어, 루마니아어, 러시아어, 세르비아어, 슬로베니아어, 태국어, 터키어
• 스페셜 피쳐 자막: 영어, 중국어, 일본어
• 화면비율: Widescreen 1.85:1


• Commentary with Director Barry Sonnenfeld
: 배리 소넨필드 감독의 음성 해설
• Alternate Ending: 또다른 결말
• Blooper Reel: NG 모음
• MIIB: ADR: ‘맨 인 블랙 2’ 후시녹음 과정
• Design in Motion: The Look of MIB II: ‘맨 인 블랙 2’의 디자인
• Rick Baker: Alien Maker: 외계인 분장 담당 릭 베이커
• Squish, Splat, Sploosh: The Stellar Sounds of MIB II
: ‘맨 인 블랙 2’의 사운드
• Cosmic Symphonies: Elfman in Space: 대니 엘프만의 음악
• Barry Sonnenfeld's Intergalactic Guide to Comedy
: 배리 소넨필드의 코미디 가이드
• Creature Featurettes: 캐릭터별 메이킹 영상
• Serleena Animatic Sequence: 셀리나 애니메틱 시퀀스
• Multi-Angle Scene Deconstructions: 멀티앵글 장면 분석
• "Black Suits Comin' (Nod Ya Head)" by Will Smith: 뮤직 비디오
*스페셜 피쳐에 한글 자막 없음

25년 전 MIB에게 당한 복수를 위해 마이크로 우주선이 지구에 침입한다. 콜라캔 크기의 우주선에서 내린 외계생명체는 여성지 모델로 자신을 복제하고 MIB 아지트에 침입한다. 그녀의 이름은 셀리나, MIB 요원 중 일부가 셀리나와 손을 잡게 된 사시을 알게 되는 제이(윌 스미스 분). 그러나 때는 이미 늦어 지구는 은하계의 전쟁에 휘말릴 위험에 처하게 된다. 위기에 놓인 지구. 요원 제이는 요원 케이(토미 리 존스)의 도움을 필요로 하게 되고 제이는 우체국 직원으로 근무중인 케이를 찾아가 기억을 복구시킨다. 이어 둘은 다시 합쳐 셀레나를 물리치고 지구를 구한다.


1편보다 더 웃기고 더 화려한 액션의 MIB II
지구에 침투한 외계인을 감시, 관리하는 미연방 일급 비밀 기관 MIB. 활달한 뉴욕 경찰 제임스는 어느날 정체불명의 검은 양복 케이를 만나고 MIB 비밀요원 제이가 된다. 외계의 다양한 생명체들을 관리하던 그들은 은하계의 악명높은 테러리스트 에드가가 불법으로 지구에 잠입한 사실을 알게 된다. MIB 팀은 힘겹게 에드가를 막아내는데, 케이는 MIB를 떠나 사랑하는 여인과 함께하기 위해 자신의 기억을 지워줄 것을 제이에게 부탁한다.
지구에 잠입한 외계인을 감시하는 MIB 요원 제이. 케이가 떠났지만 언제나 그렇듯 외계인들의 감시와 관리로 분주한 시간을 보낸다. 그러던 가운데 제이는 MIB 요원 일부가 은하계 테러집단과 손을 잡게 된 것을 알게 된다. 그러나 때는 이미 늦어 지구는 은하계의 전쟁에 휘말리고, 위기에 놓인 지구를 구하는 방법은 기억을 지우고 은퇴하여 평범하게 살고 있는 케이를 복귀시키는 것 밖에 없는데...